Te sugiero un relevamiento de operaciones haciendo diagramas de flujo y cursogramas analíticos. En cualquier libro de administración de operaciones encontraras como hacerlo, que por cierto no es para nada difícil. Hay una introducción al tema en el tomo 8 de la colección master en negocios para que tengas una idea del tema.
Haciendo eso creo que encontraras muchas cosas para mejorar ya que tendrás una idea muy precisa de como se están haciendo las cosas.
También coincido con Alberto en involucrar a la gente de cada sector ya que ellos saben mucho de los procesos y de como se podrían mejorar. Ademas de que si son tomados en cuenta después no tendrán resistencia al cambio al implementar los cambios.

Saludos.